 Bonjour à tous, ces tutoriels portent sur le piège âge photographique avec un chatillon âge par distance de détection ou camera trap distance sampling en anglais. Et plus particulièrement sur la façon de traiter vos vidéos pour obtenir les données nécessaires à l'application du camera trap distance sampling. Notre objectif final est l'estimation de la densité animale à partir des vidéos de piège photographique à l'aide du camera trap distance sampling. Pour cela, nous avons besoin de données. Tant les cas du camera trap distance sampling, ces données incluent les distances radiales entre les animaux dans les champs de vision du piège photographique et l'objectif de l'appareil. Les champs de vision étaient essentiellement tout ce que vous verrez dans votre vidéo. Si dessus il est représenté par les triangles jaunes, tandis que la distance radiale de l'animal en vue est représentée par la flèche noire. En fonction de l'espèce, d'autres données peuvent être nécessaires pour obtenir une estimation fiable de la densité, par exemple la disponibilité de l'espèce. Pour mesurer les distances radiales des animaux capturés dans vos vidéos, nous utiliserons des vidéos de référence préalablement enregistrées sur les terrains. Au cours de cette vidéo, je vous présenterai d'abord les matériels nécessaires pour réussir l'extraction de distance. Ensuite, je vous montrerai comment enregistrer les distances radiales à l'aide des vidéos de référence et je vous fournirai des conseils pour surmonter certains des difficultés que vous pourriez rencontrer pendant les processus. A la fin, j'espère que vous serez capables de vous lancer vous-même avec succès dans les processus. C'est parti ! Très peu d'équipement est nécessaire, tu peux être fait à partir de votre ordinateur. Tout d'abord, vous aurez besoin de logiciel tablette avec le Microsoft Excel si vous utilisez un PC ou Numbers si vous utilisez un Mac. Ensuite, vous devez disposer d'une application de lecture vidéo pour visualiser les images de vos pièges photographiques. Enfin, bien que vous puissiez travailler sur un seul écran, avoir un deuxième écran pour travailler les processus beaucoup plus facile et plus rapide. Préparez une position de travail confortable, les vidéos de vos espèces d'intérêt ainsi que les vidéos de référence de chaque piège photographique. Vous avez également besoin d'une feuille de calcul ouvertes, comprenant au moins les colonnes suivantes. Les noms ou l'identifiant du piège photographique indiquant par lequel de vos appareils photo l'animal avait été capturé. Assurez-vous de saisir correctement les chemins du dossier des vos vidéos et les noms des vidéos. Cela vous aidera, vous et d'autres chercheurs à trouver facilement une vidéo intéressante parmi les centaines que vous aurez. À l'avenir, cela pourrait également servir à automatiser les mesures de distance. Notez aussi la date et l'heure de vos observations. Les secondes, en particulier, sont très importantes pour des raisons que nous aborderons plus tard. Vous devez toujours avoir une colonne pour les distances radiales. Il s'agit de l'information la plus importante dans les caméras de distance sampling et elle est nécessaire pour estimer la densité animale. Enfin, vous devriez au moins avoir des colonnes pour l'idée de l'animal, la classe d'âge, in-out, la réaction et la type de comportement. L'idée de l'animal sera utilisée pour identifier un ou plusieurs animaux dans l'image vidéo et cela sera complété par les informations de classe ou d'âge. In-out indique si le centre de l'animal est ou n'est inclus dans l'action de vision du piège photographique. La réaction est particulièrement importante, comme je vous le montrerai plus tard, et les types de comportement et un complément crucial. Vous pouvez ajouter un champ d'identifiant l'espèce, par exemple, si vous décidez d'entrer les informations pour une différente espèce dans la même fête des calculs. En règle générale, plus il y a d'informations, mieux c'est. Vous ne savez jamais ce dont vous aurez besoin dans votre analyse et vous ne voulez pas révenir trop souvent sur le même vidéo. Préparez votre ordinateur pour visionner simultanément vos vidéos de référence et vos vidéos d'animaux. Une deuxième écran sera utile dans ce cas car vous pouvez avoir la vidéo de référence sur un écran et la vidéo d'un animal sur l'autre. Cependant, il est également possible de diviser votre écran en deux, comme ici. Avant de commencer à mesurer la distance, il est important de souligner quelques concepts importants du camera trap distance sampling. Rappelons tout d'abord que c'est notre objectif. Nous voulons mesurer la distance radio de l'animal au piège photographique. Comme indiqué précédemment, nous utiliserons des vidéos de référence pour accomplir notre tâche. En vrai, nous comparerons la position d'un technicien de terrain dans la vidéo de référence à celle de l'animal d'intagré. Comment mesurer cette distance radio? Heureusement, nous n'avons pas besoin d'une distance exacte. Normalement, nous localiserons l'animal dans une intervalle d'un mètre. Ce qui veut dire entre 0 et 1 m, 1 et 2 m, 3 et 4 m et ainsi de suite. Cela dépendra de votre protocole. N'étantez donc pas quelque chose de plus sophistiqué que cela. Votre mesure doit toujours être en mi-chamant entre deux intervalles de mètre. Il faut aussi rappeler que nous examinons des sections circulaires dans les champs de vision du piège photographique. Ici, la croix jaune représente un animal situé dans la section circulaire qui se trouve entre 2 et 3 m du piège photo. La distance radio de relévée dans ces cas sera de 2,5 m. Si notre animal est localisé entre 4 et 5 m, nous enregistrerons 4,5 m. C'est important de rappeler que plus les animaux sont alignés du piège photographique, plus il sera difficile de mesurer la distance. Pour cette raison, il est généralement recommandé d'utiliser des intervalles de distance supérieures au mètre, à partir de 8 m de distance. Dans cet exemple, l'intervalle de distance va des 8 à 10 m. Si un animal est observé dans cet intervalle, nous enregistrerons sa distance radiale comme la distance moyenne entre 8 et 10 m, c'est-à-dire 9 m. De même, si notre protocole prévoit un intervalle de 12 à 15 m, nous enregistrerons une distance de 13,5 m pour tous les animaux observés dans cet intervalle. Cependant, on doit se rappeler que les distances doivent être mesurées uniquement jusqu'au milieu du corps de l'animal en vue. C'est là signifie qu'ici nous ne voyons que la tête, la queue ou une jambe, nous ne mesurons pas en distance à cause de la difficulté d'obtenir mesures précises. Si le centre des animaux est en vue, nous devons ajouter IN au champ IN OUT, sinon nous mettons en valeur de OUT. Ainsi, les animaux dont le centre est en dehors du champ de vision du piège photographique ne sont pas inclus dans l'analyse des chationnages à distance. Ils peuvent néanmoins être inclus dans l'analyse pour estimer la disponibilité des animaux pour la détection par piège photographique, qui est également un paramètre extrêmement important pour estimer la densité avec précision. De plus, quelqu'un qui regardera la vidéo et la fiche technique verra que l'animal n'a pas été manqué mais classé comme étant OUT. Ici, le centre du corps de ces séphalofes rouges est bien en vue et nous sommes autorisés à enregistrer sa distance radiale. Mais ici, on ne voit que son arrière. Comme le centre n'est pas en vue, nous n'enregistrerons pas une distance radiale dans ces cas. Alors finalement, quand mesuré-t-on la distance radiale ? La réponse est uniquement des moments prédéfinis qu'on peut appeler instantanés. Plus concrètement, les instantanés sont désistants correspondant à des secondes prédéfinies dans 8 minutes, séparées par un intervalle des temps constants. Par exemple, dans cette vidéo, je vais régler les temps entre les instantanés sur deux secondes. Par conséquent, nous les mesurerons la distance qu'à 0, 2, 4, 6, 8 secondes, etc. Dans chaque minute à partir de minuit, c'est 1 minute et 0 secondes. Ce seront dans des instantanés. Cependant, l'intervalle peut être différente en 4 secondes, 6 secondes ou 10 secondes. Il est important que vous puissiez voir à quelle heure les vidéos ont été enregistrées. Dans mon cas, j'ai l'heure ici en bas de mon écran. Comme nous avons arrêté cette vidéo à 30 secondes, c'est la signifie que nous regardons un instantané. Nous devons enregistrer la distance radiale du piège photographique à ce fallot au jour. Nous n'enregistrerons qu'une distance à 31 secondes, car ce n'est pas un instantané défini avant, mais nous enregistrerons une autre distance à 32 secondes, 2 secondes après l'instantané précédente. Pouillez à 34 secondes et ainsi de suite jusqu'à ce que le CFA Love quitte le champ de vision. Cependant, d'autres pièges photographiques n'affichent pas les secondes sur les vidéos, mais seulement les heures et les minutes. Comme nous avons besoin de connaître l'instantané exact, nous devons connaître l'heure exacte à laquelle la vidéo a commencé. La solution la plus simple consiste à cliquer avec le bouton droit de la surie sur la vidéo que nous regardons et à consulter ses propriétés. Ici, nous avons des informations sur le moment où la vidéo a été créée et modifiée, incluant les secondes. La dernière fois que la vidéo a été modifiée, nous indique quand la piège photographique a cessé d'enregistrer. Comme notre vidéo dure une minute, tout ce que nous avons à faire est la soustraire une minute autant modifiée, fourni de la propriété. Et nous serons l'heure exacte à laquelle la vidéo a commencé. Les mêmes résultats peut être obtenus à l'aide d'un logiciel de traitement vidéo ou d'un programme statistique. Attention, les différents pièges photographiques ne fonctionnent pas forcément de la même manière. Avant de commencer à enregistrer une distance radiale, vous devrez trouver les moyens les plus appropriés d'extraire l'heure du début de vos vidéos. Nous sommes prêts à commencer et à regarder un exemple. Tout d'abord, nous ouvrons simultanément la vidéo d'un animal et la vidéo des références, qui correspondent aux mêmes pièges photographiques. À droite, on voit un séphalof bleu capturé dans la forêt du parc national des Nouvelles Indokis, au Congo. À gauche, se trouvent la vidéo des références ou un technicien des terrains montrant la distance aux pièges photographiques à plusieurs points de champs de vision. Nous utiliserons ces vidéos des références pour estimer à quelle distance de l'appareil se trouvait le séphalof bleu. Mais rappelez-vous, nous devons d'abord savoir quand la vidéo a été enregistrée. Si l'heure à laquelle la piège photographique a commencé à enregistrer la vidéo ne s'affiche pas ou n'affiche que les heures et les minutes, souvenez-vous que l'on peut simplement ouvrir les propriétés de la vidéo et regarder l'heure à laquelle la vidéo a été modifiée. Il est indiqué 7 heures 29 minutes et 2 secondes. Ce qui signifie que la vidéo a commencé à être enregistrée une minute plus tôt, à 7 heures 28 minutes et 2 secondes. Parce que pendant la journée, ces pièges photographiques étaient réglés pour enregistrer des vidéos, nous nous durez égal à une minute. Maintenant que nous connaissons l'heure exacte à laquelle la vidéo a été enregistrée, ramenons la vidéo avec le séphalof bleu au début. Nous devons tout d'abord nous rappeler que nous ne pouvons mesurer aucune distance tant que le milieu du corps de séphalof n'est pas en vue. Ici, le milieu du séphalof est immédiatement visible. Nous venons de déterminer que cette vidéo a commencé à 7 heures 28 minutes et 2 secondes. C'est une instantanée et nous pouvons mesurer notre première distance radio. Regardons attentivement la position de séphalof. Nous pouvons maintenant regarder les vidéos des références et essayer de déterminer où s'éteignent les séphalof. Pour ce faire, nous devons nous concentrer sur la position du technicien. Je recommande de faire très attention à ces pieds qui nous donnent généralement la meilleure idée de sa position réelle dans les champs de vision. On peut aussi se concentrer sur des objets proches du technicien, comme les petites arbres au milieu des champs de vision. Cela nous aidera à trouver des points de référence pour estimer correctement la localisation de l'animal. Dans cette vidéo, l'équipe des terrains appréciés du ruban rouge a du distance prédéterminé, ce qui nous aidera également à déterminer la position de séphalof. Néanmoins, ce n'est pas du tout une tâche facile et nous devrons peut-être visionner les vidéos plusieurs fois avant d'avoir une idée de l'endroit où s'est trouvé le séphalof. Lorsque nous sommes convaincus, nous pouvons enfin enregistrer la distance. Pour moi, au premier instantané, il semblait que les milieux de séphalof se situaient entre deux et trois mètres. Donc, dans ma faillite des calculs, j'ai rempli la colonne distance en écrivant 2,5. Et c'est notre première distance. Nous passons ensuite au deuxième instantané. On laisse filer la vidéo jusqu'au prochain instantané, qui surviendra après deux secondes. Dans ce cas, c'est simplement deux secondes après la début de la vidéo. Nous pouvons vérifier cela en utilisant la barre des temps du lecteur vidéo. Qu'à la barre affiche deux secondes, nous arrêtons la vidéo et comparons la nouvelle position à celle du technicien. Le séphalof s'est éloigné du piège photographique, mais nous voulons comprendre si le milieu du corps est au-delà de trois mètres. Donc, on regarde la position du technicien entre trois et quatre mètres. Pour moi, il semble que le séphalof est au-delà de trois mètres, entre trois et quatre mètres. Donc, dans le fait des calculs, je vais saisir qu'à 7 heures 28 minutes et quatre secondes, deux secondes après le premier instantané, le séphalof était à 3,5 mètres et répéter les processus jusqu'à ce que l'animal sorte du champ de vision. Comme notre séphalof bleu est resté dans le champ de vision pendant 24 secondes, ou 12 instantanés, notre fait des calculs pour cette vidéo rassemblera ceci. 12 distances radiales enregistrées pour le même animal, une pour chaque instantané, où le centre de l'animal s'est trouvé dans le champ de vision. Parfois, les animaux se déplacent en couple ou en groupe. Comme l'application du caméretrape distance sampling nécessite de distance à des animaux individuels, nous devons mesurer la distance à chaque animal dans le champ de vision à un instantané particulier. Ici, vous voyez deux pans congolais, une espèce syndémique de la République démocratique du Congo. Loiseau bleu est un mal et les marrons, une femelle. Dans ces cas, vous devrez insérer des lignes dans votre fait des calculs pour chaque instantané. Une pour les mal est une pour la femelle. Par exemple ici, nous utilisons la colonne animal ID pour spécifier si nous faisons référence au mal ou à la femelle. Mais parfois, vous aurez besoin de beaucoup plus de lignes, comme dans les cas des sept femelles potamoscherques et des ces quatre porcelées. Assurez-vous simplement de spécifier les dentifiantes de chaque individu à chaque instantané, comme ici. Des temps en temps, vous pouvez également observer deux espèces différentes au moment instantané. Dans ces cas, comme précédemment, vous allez ajouter une ligne pour chaque animal et avoir une colonne nommée espèce pour saisir cette information pour chaque animal. Si vos vidéos ont tendance à montrer plus souvent des groupes d'espèces mixtes, vous souhaiterez peut-être avoir une colonne supplémentaire qui indique si l'instantané correspond à une seule espèce ou à la détection d'espèces mixtes. L'une des difficultés les plus importants du camera trap distance sampling est la réaction des animaux au piège photographique. Pour éviter les désestimations de densité baillazée, nous devons exclure les instantanés d'animaux réactifs à l'appareil. Il existe plusieurs types de réaction, la plus évidente est la tirance. Ici, nous voyons un cephalop rouge s'approcher du piège photographique. Tant le cephalop a changé sa trajectoire normale pour examiner l'appareil, nous devrons écarté les distances enregistrées sur ces instantanés. En principe, nous pourrions éviter complètement de mesurer ces distances, que nous les faisons lorsque le centre de l'animal est en dehors du champ de vision. Néanmoins, on doit plutôt signaler les comportements réactifs dans notre feuille des calculs, dans la colonne réaction. Comme ici, oui, grec signifie yes. De cette façon, vous pourrez toujours revenir en arrière et vérifier toute incertitude dans les comportements réactifs. Si vous enregistrez les distances, un chercheur qui ne serait pas d'accord avec votre évaluation du comportement réactif disposerait déjà de la mesure de la distance. Ceci est un autre cas. Avec deux starcocebes aventres dorées, ce sera rémenacé endémique de la République démocratique du Congo, réagissant au piège photographique. Cependant, remarquez les cercocèdes dans les coins inférieurs droits qui apparaissent à 50 secondes. Il n'a pas réagi au piège photographique. La feuille des calculs rassemblerait à ceci. Une entrée pour chaque individu? Asseurez-vous de préciser les individus qui réagissent et ceux qui ne réagissent pas. D'autres réactions sont plus subtiles. Par exemple, les bonobos ont l'habitude de s'arrêter à quelques mètres de piège pour l'examiner. Si nous incluons ces instantanés, nous risquons de surestimer la densité. Nous ne voulons pas cela. Par conséquent, nous devons signaler les instantanés réactifs et les exclure de notre analyse. Voyons comment. Dans cet exemple, les bonobos remarquent la piège photographique à 55 secondes. Ça arrête et le regarde pendant quelques secondes. Ils changent alors de trajectoire et sort du champ de vision. Ici, je n'enregistrerai que des instantanés jusqu'à 54 secondes. Puis, signalerait une réaction pour 5 instantanés consécutifs de 56 à 4 secondes. Puis, j'enregistrerai à nouveau le dernier instantané à 6 secondes lorsque le bonobo quitte le champ de vision. Comme c'est là, les éléphants sont encore plus compliqués. Ils ne regardent pas toujours directement le piège, mais ça arrête et examine la zone avec leur trompe. Ils peuvent faire ça pendant longtemps. Dans ces cas, j'enregistrais uniquement le premier instantané, même si l'élephant enregistrait déjà et j'ai signalé qu'on réactive tout ce qui suivait. Les éléphants posent également un autre problème. Ils sont si gros qu'il faut tenir compte non seulement de leur longueur, mais aussi de leur largeur. En règle générale, si l'élephant est placé horizontalement par rapport au piège photographique, nous ajouterons un mètre supplémentaire à la distance mesurée au point le plus proche. Et c'est tout, merci pour votre attention.