 Il laboratorio di prestoria del Dipartimento di Scienze Storiche e dei beni culturali dell'Università di Siena si trova all'interno del complesso dei servi. Le attività svolte dal gruppo di ricerca spazzano da un livello teorico-formativo ad uno più tecnico-pratico, coinvolgendo ricercatori e studenti in diverse attività, come il laboratorio di ceramologia e quello di industrialitica. Attraverso la ricostruzione grafica delle forme ceramiche e lo studio dei processi tecnologici usati per la loro realizzazione è possibile definire datazioni relative dei contesti, ottenere diverse informazioni sugli aspetti funzionali dei contenitori o sull'organizzazione sociale ed economica dei gruppi umani. Con l'analisi degli strumenti in pietra, si può determinare la materia prima e le tecniche usate per la loro realizzazione, identificarli in tipi precisi e attribuirli un ambito cronologico e geografico. Grazie al loro studio è quindi possibile comprendere il livello tecnologico dei più antichi gruppi umani e le relative scelte economiche. Collegato allo studio dei repertilitici è di fondamentale importanza il laboratore di traciologia. Con specifico osservazione al microscopio è possibile infatti riconoscere l'uso che era stato fatto del singolo manufatto e capire quale materia prima aveva lavorato e in che modo. Di grande rilevanza per l'area di pre-storia è il laboratore di archeologia sperimentale, che si basa sulla ricostruzione e riproduzione dei manufatti antichi, sia oggetti che strutture. L'interesse di ricerche è molto ampio, spazia dallo studio dei manufatti litici e ceramici, fino a quello sui manufatti in materia duranimale e metallo. I risultati dell'archeologia sperimentale sono utili nei parchi e nei musei per raccontare al pubblico quello che si conosce del passato. Il laboratore di antropologia è dedicato allo studio dello scheletro umano e alla sua evoluzione. Con questa attività, correlata al corso di archeologia funeraria, è possibile apprendere nozioni di antropologia fisica o di riconoscimento dei distretti scheletrici. Peculare del laboratorio è la possibilità di prendere visione delle collezioni di copi di crani di differenti tipi umani che hanno caratterizzato il processo di ominazione. Il laboratorio d'informatica applicata alla ricerca prestorica è dedicato ad attività di gestione e di archiviazione delle informazioni con database GIS e all'acquisizione e della laborazione digitale dei dati di scavo, utili ad interpretare i contesti prestorici a scala sito e a scala territorio. Le analisi spaziale dei dati sono fortemente correlate anche alla ricerca sui basaggi prestorici. All'interno di questo laboratorio sono svolte diverse attività di resa tridimensionale di manufatti di contesti, utili per la ricerca ma anche per migliorare la fuizione e l'accessibilità al pubblico delle evidenze archeologiche.